Anklagemyndigheden er organiseret i følgende advokaturer:

• Advokatur for personfarlig kriminalitet
• Advokatur for økonomisk kriminalitet
• Advokatur for organiseret kriminalitet
• Advokatur for særlovssager
• Advokatur for særlige sager  

Anklagemyndigheden afgør påtalespørgsmål inden for strafferetsplejen samt varetager straffesager ved byretterne i Aarhus og Randers. Juristerne fra anklagemyndigheden yder endvidere juridisk rådgivning og vejledning i forbindelse med politiets efterforskning og andre politimæssige opgaver og indgår derfor som et væsentligt element i politikredsens arbejde med legalitetssikring.  

Juristerne arbejder tæt sammen med politifolkene, der efterforsker forbrydelser. Derefter vurderer juristen, om sagen skal rejses i byretten med henblik på at få gerningsmanden dømt, eller om den af bevismæssige eller andre grunde skal sluttes.